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为了解台湾研究型大学的学术竞争力，台湾财团法人高等教育评鉴中心基金会去年首度研发推出「世界大学科研论文质量评比」排名系统 (HEEACT Ranking)，从「学术生产力」、「学术影响力」及「学术卓越性」三大评估面向，针对世界大学科学研究论文进行质量表现评比，列出世界前五百大名单，以中英文分别公布于网站。其中台湾5校进前500大，大陆高校方面清华大学 (152名),北京大学 (164名),香港大学 (173名)。

这项评比推出后深受国际重视，将HEEACT Ranking与上海交大、英国时报高等教育增刊、西班牙世界大学网路排名的三大全球大学排名系统并列讨论，澳洲国家教育部更公开参考采用。

2008年世界大学科研论文不分领域的前五百大排名，美国就占一百六十三校，并包办前十一名，依序为哈佛大学、约翰霍普金斯大学、史丹福大学、华盛顿大学西雅图分校、加州大学洛杉矶分校、加州大学柏克莱分校、密西根大学安娜堡分校、麻省理工学院、加州大学旧金山分校、加州大学圣地牙哥分校、宾州大学。

前五百大的不分领域排名中，亚洲地区由日本三十五校居冠，日本东京大学排名第十二；其次为中国大陆十三校，再来为香港与台湾各五校。

分领域排名方面。台湾共有台大、成功、清华、交通、中央大学、中山大学、台湾科大、中兴大学等八所大学在工科领域 。台大、清华、成功、交通四校在理科领域 。台大、中兴两校在农学领域 。台大、阳明两校在临床医学领域 。台大一校在生命科学领域分别进入世界前三百强。而社会科学领域则没有学校进榜。

分析华人地区大学表现，绝大多数排名进步，其中新加坡国立大学 (86名，去年96名)进入世界百大，台湾大学则超越香港大学，跃升为两岸三地第一 (141名，去年185名)，其次为北京清华大学 (152名，去年250名)、北京大学 (164名，去年241名)及香港大学 (173名，去年182名)。 via

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